中华革命党成立后，继续进行反袁斗争，而且成为资产阶级各派中反袁最坚决的力量。它不断派遣党员，在上海、山东、江苏、广东等地联络军队，组织反袁暴动。1915年12月，在上海发动了肇和军舰起义。
肇和军舰起义之前，孙中山等人制定了较为详细的起义计划： 首先由停泊在上海的肇和军舰发动起义，攻打江南制造总局、电话局和警察总局; 应瑞、通济两舰随即响应，参加武装起义; 陆上革命党人联络军队举事响应，一举夺取上海。
12月5日，肇和军舰如期发动起义，炮击江南制造总局，并一度占领了上海电话局，截断了上海与外界的通讯联系。应瑞、通济两舰未能及时响应。原来是起义计划早已泄露，应瑞、通济两舰被敌人所收买，转而集中炮火，猛攻肇和军舰。陆上的革命党人没有造成起义的强大声势，起义旋即被镇压。肇和军舰起义失败的实践证明，中华革命党未能明确提出反帝反封建的纲领，在活动方式上又脱离群众，所以又重犯了单纯军事冒险的错误。